生物化学原理（第4版）

本版封面设计主题聚焦于“中心法则”。封面背景呈现的是DNA序列，其中浅橘红色标识的部分为miRNA位点，这些位点在基因表达调控等生物过程中发挥着关键作用。覆盖背景上的是由A、C、G、T、U拼成的四种生物大分子的词云图案，从上到下、从左到右依次为：tRNA、PIEZO蛋白、F1Fo-ATP合酶、丙糖磷酸异构酶。它们各自在细胞不同的生化过程中扮演着重要角色。

词云中还加入了“ILOVEBIOCHEMISTRY”的小彩蛋，希望大家在生物化学的学习中深深爱上这一充满奥秘与惊喜的学科！

目录
- 前辅文
- 第一篇结构生物化学
  - 结构生物化学内容简介和学习方法
  - 第一章绪论
    - 第一节生物化学发展简史
    - 第二节生物化学的主要内容
    - 第三节生物化学的应用
    - 科学故事——中国科学家是如何在世界上率先人工合成出第一种蛋白质的？
  - 第二章氨基酸
    - 第一节氨基酸的结构
      - 一、蛋白质氨基酸
      - 二、非蛋白质氨基酸
    - 第二节氨基酸的性质
      - 一、大多数或者所有的氨基酸具有的性质
      - Box2-1 生物医药——药物的手性
      - 二、个别氨基酸的侧链性质及其对蛋白质功能的贡献
    - 第三节氨基酸的功能
    - 科学故事——第22种蛋白质氨基酸的发现
  - 第三章蛋白质的结构
    - 第一节肽
      - 一、肽的分类和命名
      - 二、寡肽的理化性质
      - 三、几种天然存在的活性肽
      - Box3-1 生化点滴——五花八门的蛋白质命名方法
    - 第二节蛋白质的各级结构
      - 一、蛋白质的一级结构
      - 二、蛋白质的二级结构
      - Box3-2 生化大师的传奇——感冒期间的感悟
      - 三、蛋白质的三级结构
      - 四、蛋白质的四级结构
    - 第三节蛋白质的折叠历程与结构预测
      - 一、蛋白质折叠的基本规律
      - 二、蛋白质折叠的历程
      - Box3-3 大蛋白“能屈能伸”的故事
      - 三、与蛋白质错误折叠相关的疾病
      - 四、蛋白质结构预测
    - 第四节蛋白质与蛋白质的相互作用
      - 一、蛋白质之间相互作用的方式
      - 二、蛋白质之间相互作用的生物学效应
      - 三、蛋白质之间相互作用研究的主要方法
    - 第五节蛋白质组及蛋白质组学
    - 科学故事——“一级结构决定三维结构”学说的提出
  - 第四章蛋白质的功能
    - 第一节蛋白质的主要功能
    - 第二节蛋白质结构与功能关系的一般规则
    - 第三节几类重要的蛋白质的结构与功能
      - 一、纤维状蛋白质的结构与功能
      - 二、球状蛋白质的结构与功能
      - Box4-1 难以置信的骆驼和鲨鱼的小抗体的发现及其巨大的应用前景
      - 三、膜蛋白的结构与功能
      - 四、天然无折叠蛋白质的结构与功能
      - Box4-2 生化新发现——天然无折叠蛋白质的新功能
    - 第四节蛋白质功能预测
    - 科学故事——一种多功能蛋白质的发现
  - 第五章蛋白质的性质及研究方法
    - 第一节蛋白质的性质
      - Box5-1 生化探究——嗜热蛋白和嗜冷蛋白各自耐热和抗冷的秘密
    - 第二节蛋白质的分类
      - Box5-2 生活在深海里的“嗜压生物”的抗压秘诀
    - 第三节蛋白质的研究方法
      - 一、蛋白质的分离和纯化
      - 二、蛋白质大小的确定
      - 三、蛋白质pI的测定
      - 四、蛋白质在机体内表达的分析
      - 五、蛋白质一级结构的测定
      - 六、蛋白质三维结构的确定
      - 七、蛋白质功能的研究
      - 八、多肽的固相合成
    - 科学故事——神经生长因子的发现
  - 第六章核苷酸
    - 第一节核苷酸的组成与结构
      - 一、碱基
      - Box6-1 生化新视野——DNA分子中真正的第五个碱基被发现啦！
      - 二、核苷
      - 三、核苷酸
    - 第二节核苷酸的性质和功能
    - 科学故事——“生命字母表”的人工扩增
  - 第七章核酸的结构与功能
    - 第一节核酸的分类
      - Box7-1 生化聚焦——DNA分子一定没有“你”（U）吗？
    - 第二节核酸的一级结构
    - 第三节核酸的二级结构
      - 一、DNA的二级结构
      - Box7-2 生化探究——“大沟”和“小沟”中的秘密
      - 二、RNA的二级结构
      - Box7-3 生化探究——DNA究竟能不能形成正平行的双螺旋？
    - 第四节核酸的三级结构
      - 一、DNA的三级结构
      - 二、RNA的三级结构
    - 第五节核酸与蛋白质的相互作用
      - 一、脱氧核糖核酸蛋白颗粒
      - 二、核糖核酸蛋白颗粒
    - 第六节核酸的功能
    - 科学故事——DNA双螺旋结构的发现
  - 第八章核酸的性质及研究方法
    - 第一节核酸的性质
      - Box8-1 生化探究——嗜热生物是如何保护自己的基因组DNA的？
      - Box8-2 生化动态——天然核酸分子中含有硫吗？
    - 第二节核酸的研究方法
      - 一、核酸的化学合成
      - 二、核酸的分离、纯化和定量
      - 三、核酸一级结构的测定
      - Box8-3 生化趣事——年度分子和年度突破
    - 科学故事——基因组数据库的建立
  - 第九章酶学概论
    - 第一节酶的化学本质
      - Box9-1 生化热点——DNA究竟能不能催化反应？
    - 第二节酶的催化性质
      - Box9-2 生化趣事——催化动力、生化武器与投弹手甲虫
    - 第三节酶的分类和命名
      - 一、酶的分类
      - 二、酶的命名
    - 科学故事——酶化学本质的确定
  - 第十章酶动力学
    - 第一节影响酶促反应的因素
      - 一、影响反应速率的外因
      - 二、影响反应速率的内因
    - 第二节米氏动力学
      - 一、米氏方程成立的前提
      - 二、米氏方程的推导
      - 三、米氏方程的解读和延伸
      - Box10-1 理论联系实际——甲醇、乙二醇或二甘醇中毒的解毒
      - 四、米氏方程的双重性
      - 五、米氏方程的线性转换
    - 第三节米氏酶抑制剂作用的动力学
      - 一、可逆性抑制剂
      - 二、不可逆性抑制剂
    - 第四节多底物反应动力学
      - 一、多底物反应中的一些专业术语
      - 二、多底物反应的动力学机制
    - 第五节别构酶的动力学
      - 一、别构酶的性质
      - 二、别构酶的动力学方程
      - 三、Hill作图
      - 四、协同性的生物学意义
    - 科学故事——阿司匹林的发现：从柳树皮到灵丹妙药
  - 第十一章酶的催化机制
    - 第一节酶催化机制研究的主要方法
    - 第二节过渡态稳定学说
      - 一、“过渡态稳定”学说的内容
      - 二、支持“过渡态稳定”学说的证据
      - Box11-1 生化制药——水解可卡因酶的研制
    - 第三节过渡态稳定的化学机制
      - 一、邻近定向效应
      - 二、广义的酸碱催化
      - 三、静电催化
      - 四、金属催化
      - 五、共价催化
      - 六、底物形变
    - 第四节几种蛋白酶的结构与功能
      - 一、丝氨酸蛋白酶和巯基蛋白酶
      - 二、天冬氨酸蛋白酶和金属蛋白酶
    - 科学故事——溶菌酶的发现及其催化机制的研究
  - 第十二章核酶
    - 第一节核酶的种类
    - 第二节核酶的催化机制
      - 一、小核酶的催化机制
      - 二、大核酶的催化机制
      - Box12-1 生化新见解：在“RNA世界”之前可能还有一个“XNA世界”
    - 第三节核酶发现的意义及其应用
    - 科学故事——核酶的发现
  - 第十三章酶活性的调节
    - 第一节酶的“量变”
      - 一、同工酶
      - 二、酶的合成和降解
    - 第二节酶的“质变”
      - 一、别构调节
      - 二、共价修饰调节
      - 三、水解激活
      - 四、受调节蛋白的激活或抑制
      - Box13-1 生化趣事——“分子捕鼠器”的威力
      - 五、液-液相分离
    - 科学故事——假酶的发现
  - 第十四章维生素与辅酶
    - 第一节水溶性维生素
      - 一、B族维生素
      - Box14-1 生化应用——生物素-亲和素检测系统的建立和应用
      - 二、维生素C
      - Box14-2 生化聚焦——人类为什么自己合成不了维生素C？
    - 第二节脂溶性维生素
      - 一、维生素A
      - 二、维生素D
      - 三、维生素E
      - 四、维生素K
      - Box14-3 生化揭秘——植物需要哪些维生素？
    - 科学故事——维生素的发现
  - 第十五章酶的应用及研究方法
    - 第一节酶活力的测定
      - 一、酶活力的表示方法
      - 二、酶活力测定的方法
    - 第二节酶的分离和纯化
    - 第三节酶工程
      - 一、固定化酶
      - 二、人工酶
      - Box15-1 生化动态——抗体酶的新来源
      - 三、定点突变酶
      - 四、杂交酶
      - 五、计算机辅助酶设计
    - 科学故事——第一例从头设计的人工酶的诞生
  - 第十六章糖类
    - 第一节单糖
      - 一、单糖的命名和缩写
      - 二、单糖的结构
      - 三、单糖的性质
      - 四、生物体内几种重要的单糖
      - 五、单糖的衍生物
      - Box16-1 生化与健康——是告别代糖的时候了
    - 第二节寡糖
      - 一、还原性二糖
      - 二、非还原性二糖
    - 第三节多糖
      - 一、贮能多糖
      - 二、结构多糖
    - 第四节糖缀合物
      - 一、糖蛋白和蛋白聚糖
      - 二、肽聚糖
      - 三、糖脂与脂多糖
    - 第五节糖组与糖组学
    - 科学故事——揭开生命的手性选择之谜
  - 第十七章脂质
    - 第一节脂质的结构与功能
      - 一、简单脂
      - Box17-1 生化与健康——因纽特人健康的秘密
      - 二、复合脂
      - 三、异戊二烯类脂
    - 第二节生物膜的结构及其功能
      - 一、生物膜的化学组成
      - 二、生物膜的基本结构与性质
      - Box17-2 生化动态——脂质体的应用
    - 第三节脂质组与脂质组学
    - 科学故事——水孔蛋白的发现
  - 第十八章激素
    - 第一节激素的一般性质
      - 一、激素的定义
      - 二、激素的化学本质及分类
      - Box18-1 生化与健康——瘦肉精、喘息定与萘心安
      - 三、激素的定量
    - 第二节激素作用的一般特征
      - 一、特异性
      - 二、高效性
      - 三、可能需要“第二信使”
      - 四、可能产生“快反应”或“慢反应”
      - 五、脱敏性
      - 六、时效性
    - 第三节激素作用的详细机制
      - 一、脂溶性激素的作用机制
      - 二、水溶性激素的作用机制
      - Box18-2 生化趣事——毒气是毒是福？
      - 三、信号终止
    - 第四节激素作用的整合
    - 第五节激素的分泌及其调节
    - 科学故事——蛋白质“可逆磷酸化”的发现
- 第二篇代谢生物化学
  - 代谢生物化学内容简介及学习方法
  - 第十九章代谢总论
    - 第一节代谢的基本概念
      - Box19-1 生化聚焦——底物通道运输
    - 第二节代谢的基本特征
    - 第三节代谢研究的主要内容和方法
      - Box19-2 生化突破——让“酵母君”酿造鸦片
    - 第四节代谢组和代谢组学
  - 第二十章生物能学
    - 第一节热力学定律与Gibbs-Helmholtz方程
    - 第二节生化反应的方向性与自由能之间的关系
    - 第三节 ΔG与ΔE之间的关系
    - 第四节生命系统内的偶联反应
    - 第五节高能生物分子
      - Box20-1 生化探究：生物在进化中选择ATP作为通用能量货币的可能原因
    - 科学故事——ATP的发现
  - 第二十一章生物氧化
    - 第一节呼吸链
      - 一、呼吸链的组分
      - 二、呼吸链组分的排列顺序
      - 三、复合体Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ的结构与功能
      - 四、呼吸体
      - Box21-1 生化动态——厌氧生物的呼吸链
    - 第二节氧化磷酸化
      - 一、氧化磷酸化的偶联机制
      - Box21-2 生化新进展：科学家成功地将一种蛋白质引入到线粒体内膜上，让动物细胞也能利用光能制造ATP
      - 二、质子梯度建立的机制
      - 三、质子梯度驱动ATP合成的机制
      - 四、氧化磷酸化的抑制
      - 五、氧化磷酸化的调节
    - 科学故事——“结合变构”机制的发现
  - 第二十二章生物大分子的消化和吸收
    - 第一节糖类在动物消化道内的消化和吸收
      - 一、寡糖和多糖的酶促降解
      - 二、单糖的吸收和转运
    - 第二节脂质在动物消化道内的消化和吸收
      - 一、脂质的酶促降解
      - 二、脂质的吸收
    - 第三节蛋白质在动物消化道内的消化和吸收
      - 一、蛋白质的酶促降解
      - 二、氨基酸、二肽和三肽的吸收
    - 第四节核酸在动物消化道内的消化和吸收
      - Box22-1 生化趣事——科学家发现专吃DNA的细菌
    - 第五节真菌和食虫植物对生物大分子的消化和吸收
      - Box22-2 身边的生物化学——猪笼草吃荤的秘密
    - 科学故事——葡萄糖转运蛋白的发现
  - 第二十三章糖酵解
    - 第一节糖酵解的发现
    - 第二节糖酵解的全部反应
    - 第三节 NADH和丙酮酸的命运
      - 一、在有氧状态下NADH和丙酮酸的命运
      - 二、在缺氧或无氧状态下NADH和丙酮酸的命运
      - Box23-1 生化趣事——不喝酒也醉酒的秘密
    - 第四节其他物质进入糖酵解
      - 一、糖原
      - 二、果糖
      - 三、甘露糖
      - 四、半乳糖
      - 五、甘油
    - 第五节糖酵解的功能
      - Box23-2 生化探究——有没有动物也能进行乙醇发酵？
    - 第六节糖酵解的调控
      - 一、葡萄糖的可得性
      - 二、己糖激酶和葡萄糖激酶的调控
      - 三、PFK1的调控
      - 四、丙酮酸激酶的调控
      - Box23-3 生化理论联系实际——教你制作葡萄酒
  - 第二十四章三羧酸循环
    - 第一节三羧酸循环的发现
    - 第二节三羧酸循环的全部反应
      - 一、反应历程
      - 二、三羧酸循环小结
    - 第三节三羧酸循环的功能
      - Box24-1 生化突破——科学家发现了非标准的三羧酸循环
    - 第四节三羧酸循环的回补反应
    - 第五节三羧酸循环的调控
      - 一、柠檬酸合酶的调控
      - 二、异柠檬酸脱氢酶的调控
      - 三、α-酮戊二酸脱氢酶系的调控
      - 四、丙酮酸脱氢酶系的调控
      - 五、乙酰化修饰对TCA循环酶的调节
    - 第六节乙醛酸循环
      - 一、与TCA循环的异同
      - 二、乙醛酸循环的功能
      - 三、乙醛酸循环的调控
    - 科学故事——还原型TCA循环的发现和意义
  - 第二十五章戊糖磷酸途径
    - 第一节戊糖磷酸途径的全部反应
      - 一、氧化相
      - 二、非氧化相
      - 三、戊糖磷酸途径小结
    - 第二节戊糖磷酸途径的功能
      - 一、与NADPH有关的功能
      - 二、与核糖-5-磷酸有关的功能
      - 三、与木酮糖-5-磷酸有关的功能
      - 四、与赤藓糖-4-磷酸有关的功能
      - Box25-1 生化与健康——蚕豆与溶血性贫血
    - 第三节戊糖磷酸途径的调控
      - 一、产物的反馈抑制
      - 二、共价修饰
      - 三、调节蛋白的调节
      - 四、酶基因的表达调控
      - Box25-2 生化新发现——蝌蚪原来是通过增强尾部细胞PPP的活性来驱动尾巴再生的
    - 科学故事——恩特纳和杜多罗夫途径的发现
  - 第二十六章糖异生
    - 第一节糖异生的原料及其所涉及的全部反应
      - 一、糖异生的原料
      - 二、糖异生的反应
      - 三、其他非糖物质进入糖异生
      - 四、糖异生的能量消耗
    - 第二节糖异生的功能
      - Box26-1 为什么猫不能吃阿司匹林？
    - 第三节糖异生的调控
      - 一、葡萄糖-6-磷酸酶的调控
      - 二、果糖-1，6-二磷酸酶的调控
      - 三、PEPCK和丙酮酸羧化酶的调控
    - 科学故事——治疗糖尿病的“神药”二甲双胍的发现及其作用机制的研究
  - 第二十七章光合作用
    - 第一节光合作用的基本性质
      - 一、光合作用的本质
      - 二、光合作用的基本过程
      - 三、光合作用的场所
    - 第二节光合作用的分子机制
      - 一、光反应
      - Box27-1 生化新进展：光合作用光反应的高效率原来与一种奇怪的物理状态有关
      - 二、暗反应
    - 第三节光合作用的调控
      - 一、光反应的调控
      - 二、暗反应的调控
    - 科学故事——卡尔文循环的发现
  - 第二十八章糖原代谢
    - 第一节糖原的分解
      - 一、细胞质基质内糖原的分解
      - 二、溶酶体内糖原的分解
      - Box28-1 生化研究动态——神经元如何动用星形胶质细胞中的糖原贮备？
    - 第二节糖原的合成
      - 一、糖原合成的一般特征
      - 二、糖原合成的详细步骤
    - 第三节糖原代谢的调控
      - 一、别构调节
      - 二、受激素控制的“可逆磷酸化”调节
      - Box28-2 生化与健康——糖原累积病的病因、症状和治疗
    - 科学故事——糖原素的发现
  - 第二十九章脂肪、磷脂和糖脂的代谢
    - 第一节脂肪代谢
      - 一、脂肪的分解
      - 二、脂肪的合成
      - Box29-1 生化与健康——TZD治疗2型糖尿病的机理
    - 第二节磷脂代谢
      - 一、磷脂的分解
      - 二、磷脂的合成
    - 第三节糖脂代谢
      - 一、糖脂的分解
      - 二、糖脂的合成
    - 科学故事——瘦素及其受体的发现
  - 第三十章脂肪酸代谢
    - 第一节脂肪酸的分解
      - 一、脂肪酸的β氧化
      - 二、脂肪酸的α氧化和ω氧化
      - 三、酮体的生成和利用
      - Box30-1 生化趣事——让魏茨曼生物发酵产生丙酮
    - 第二节脂肪酸的合成
      - 一、脂肪酸合成的一般性质
      - 二、细胞质基质内的脂肪酸合成
      - 三、真核细胞线粒体内的脂肪酸合成
    - 第三节脂肪酸代谢的调控
      - 一、脂肪酸分解代谢的调控
      - 二、脂肪酸合成代谢的调控
      - Box30-2 生化与健康——减肥的新希望
  - 第三十一章胆固醇代谢
    - 第一节胆固醇的合成
      - 一、甲羟戊酸的形成
      - 二、活化的异戊二烯的形成
      - 三、鲨烯的形成
      - 四、胆固醇的形成
    - 第二节胆固醇合成的调控
      - 一、HMGCR的调控
      - 二、SM的调控
    - 第三节胆固醇的转运
      - 一、消化道对食物中胆固醇的吸收
      - 二、胆固醇在循环系统中的运输以及细胞对循环系统中的胆固醇的吸收
      - 三、胞内胆固醇的外排
      - Box31-1 生化探究：为什么拥有APOE4基因会增加一个人得阿尔茨海默症的风险？
    - 第四节胆固醇的分解和转化
      - 一、氧化成氧甾醇
      - 二、酯化成胆固醇酯
      - 三、转变成胆汁酸
      - 四、转变成维生素D
    - 科学故事——LDL受体的发现
  - 第三十二章氨基酸代谢
    - 第一节氨基酸的分解
      - 一、脱氨基作用
      - 二、氨基的进一步代谢
      - Box32-1 真的难以置信：科学家在阿尔茨海默病患者的神经胶质细胞中发现完整的尿素循环
      - 三、碳骨架的代谢
    - 第二节氨基酸及其衍生物的合成
    - 科学故事——科学家发现海洋中微小硅藻也有尿素循环
  - 第三十三章核苷酸代谢
    - 第一节核苷酸的合成
      - 一、核苷酸的从头合成
      - 二、核苷酸的补救合成
      - 三、NDP和NTP的合成
      - 四、脱氧核苷酸的合成
      - 五、dTMP的合成
    - 第二节核苷酸合成的调控
      - 一、嘌呤核苷酸合成的调控
      - 二、嘧啶核苷酸合成的调控
      - 三、脱氧核苷酸合成的调控
      - Box33-1 生化聚焦——噬菌体对宿主菌内核苷酸代谢途径的改造
    - 第三节核苷酸的分解
      - 一、嘌呤核苷酸的分解
      - 二、嘧啶核苷酸的分解
    - 第四节几种与核苷酸代谢异常相关的疾病
      - 一、痛风
      - 二、严重联合免疫缺陷症
      - 三、Lesch-Nyhan综合征
      - 四、乳清酸尿症
    - 第五节抗核苷酸代谢药物在医学上的应用
      - 一、叶酸类似物
      - 二、谷氨酰胺类似物
      - 三、碱基类似物
      - 四、核苷类似物
    - 科学故事——核糖核苷酸还原酶的发现
  - 第三十四章代谢的整合
    - 第一节单个细胞内代谢的整合
    - 第二节以哺乳动物为代表的多细胞生物细胞间的代谢整合
      - 一、不同细胞或器官在代谢上的分工
      - Box34-1 科学家发现肌苷居然可作为信号分子促进脂肪的燃烧！
      - 二、神经、内分泌系统对代谢的整合
      - Box34-2 生化新突破：科学家发现一种独立于胰岛素调节血糖水平的新途径
    - 科学故事——AMPK的发现
- 第三篇分子生物学
  - 分子生物学内容简介及学习方法
  - 第三十五章 DNA复制
    - 第一节 DNA复制的一般特征
      - Box35-1 生化新突破——DNA生物合成一定需要引物吗？
    - 第二节参与DNA复制的主要酶和蛋白质
      - 一、DNA聚合酶
      - 二、DNA解链酶
      - 三、单链结合蛋白
      - 四、DNA拓扑异构酶
      - 五、DNA引发酶
      - 六、切除引物的酶
      - 七、DNA连接酶
      - 八、端粒酶
    - 第三节 DNA复制的详细机制
      - 一、以大肠杆菌为代表的细菌基因组DNA的“θ复制”
      - 二、滚环复制
      - 三、D环复制
      - 四、真核细胞的细胞核DNA复制
      - 五、古菌的DNA复制
      - Box35-2 生化动态——DNA复制也有节律
    - 第四节 DNA复制的高度忠实性
    - 第五节 DNA复制的调控
      - 一、细菌DNA复制起始的调控
      - 二、真核细胞DNA复制起始的调控
    - 科学故事——DNA半保留复制的实验证明
  - 第三十六章 DNA的损伤、修复和突变
    - 第一节 DNA的损伤
      - 一、碱基损伤
      - 二、DNA链损伤
      - Box36-1 生化与健康：真酒和假酒一样有害健康
    - 第二节 DNA的修复
      - 一、直接修复
      - 二、切除修复
      - 三、链断裂修复
      - 四、损伤跨越
      - Box36-2 生化新发现——原来癌细胞也可以像细菌一样发生SOS反应
    - 第三节 DNA的突变
      - 一、突变的类型与后果
      - 二、突变的原因
      - Box36-3 物理学家和化学家使用量子力学解释了为什么DNA复制不可避免出错的一种重要机制
      - 三、回复突变与校正突变
      - 四、突变原与致癌物质之间的关系以及致癌物质的检测
    - 科学故事——大肠杆菌DNA聚合酶Ⅳ和V的发现之路
  - 第三十七章 DNA重组
    - 第一节同源重组
      - 一、同源重组的模型
      - 二、参与同源重组的主要酶和蛋白质
      - 三、细菌的同源重组
    - 第二节位点特异性重组
      - 一、λ噬菌体DNA的位点特异性整合
      - 二、鼠伤寒沙门氏菌鞭毛抗原的转换
    - 第三节转座重组
      - 一、细菌的转座子
      - 二、真核生物的转座子
      - Box37-1 睡美人转座子的复活
      - Box37-2 生化新突破：科学家确认一种逆转座子在哺乳动物早期发育中起重要作用
      - 三、古菌的转座子
      - 四、转座的分子机制
      - 五、转座作用的调节
    - 科学故事——“跳跃基因”的发现
  - 第三十八章 DNA转录
    - 第一节 DNA转录的一般特征
    - 第二节依赖DNA的RNA聚合酶
      - 一、细菌的RNA聚合酶
      - 二、真核生物的RNA聚合酶
      - Box38-1 身边的生物化学——路边的“野蘑菇”请不要乱采
      - 三、古菌的RNA聚合酶
      - 四、某些病毒的RNA聚合酶
      - Box38-2 RNA聚合酶和DNA聚合酶如何识别NTP和dNTP？
    - 第三节细菌的DNA转录
      - 一、转录的起始
      - 二、转录的延伸
      - 三、转录的终止
    - 第四节真核生物的DNA转录
      - 一、细胞核DNA转录
      - 二、细胞器DNA的转录
      - Box38-3 细胞在受热条件下是如何借助液-液相分离下调大多数基因的表达的？
    - 第五节古菌的DNA转录
    - 科学故事——mRNA的发现
  - 第三十九章转录后加工
    - 第一节细菌的转录后加工
      - 一、mRNA前体的后加工
      - 二、rRNA前体的后加工
      - 三、tRNA前体的后加工
    - 第二节真核生物的转录后加工
      - 一、mRNA前体的后加工
      - Box39-1 生化新进展——RNA在5′端还可能有非典型帽子
      - Box39-2 生化聚焦——章鱼抗寒的秘密
      - 二、rRNA前体的后加工
      - 三、tRNA前体的后加工
    - 第三节古菌的转录后加工
      - Box39-3 生化新突破：科学家首次发现，一种嗜热古菌的tRNA在内部核糖上的2′-羟基上还可以发生可逆的磷酸化修饰
    - 科学故事——第一例真正核酶的发现
  - 第四十章 RNA复制
    - 第一节依赖于RNA的RNA复制
      - 一、双链RNA病毒的RNA复制
      - 二、单链RNA病毒的RNA复制
    - 第二节以DNA为中间物的RNA复制
      - 一、逆转录病毒的RNA复制
      - Box40-1 身边的生物化学——有天生不会感染HIV的人吗？
      - 二、逆转座子
      - 三、端粒酶催化的逆转录反应
      - 四、某些DNA病毒生活史中的逆转录现象
      - Box40-2 并非所有病毒都是敌人
    - 科学故事——逆转录酶的发现
  - 第四十一章 mRNA翻译
    - 第一节参与翻译的主要生物大分子以及复合物
      - 一、核糖体
      - 二、mRNA
      - 三、tRNA
      - 四、氨酰tRNA合成酶
      - 五、蛋白质辅因子
    - 第二节翻译的一般特征
      - Box41-1 非AUG起始密码子究竟编码什么氨基酸？
    - 第三节翻译的详细机制
      - 一、细菌的翻译系统
      - 二、真核生物的细胞质翻译系统
      - 三、细胞器翻译系统
      - 四、古菌的翻译系统
    - 第四节再次程序化的遗传解码
      - 一、翻译水平的移框
      - 二、通读
      - 三、跳跃翻译
      - 四、Sec和Pyl的掺入
    - 第五节翻译的质量控制
      - 一、细菌的翻译质量控制
      - 二、真核生物的翻译质量控制
      - 三、古菌的翻译质量控制
      - Box41-2 科学家发现了一种全新的质量控制系统，可修复由醛类物质在体内诱发产生的RNA-蛋白质共价交联
    - 第六节翻译的抑制剂
      - 一、细菌翻译系统的抑制剂
      - 二、古菌或真核翻译系统的抑制剂
      - Box41-3 身边的生物化学——为什么蓖麻毒素不会杀死蓖麻自身？
      - 三、既抑制细菌又抑制古菌和真核翻译系统的抑制剂
    - 科学故事——遗传密码的破译之路
  - 第四十二章翻译后加工
    - 第一节翻译后加工方式
      - 一、剪切
      - 二、N端添加氨基酸
      - 三、剪接
      - Box42-1 生化探寻——内含肽的“内涵”
      - 四、个别氨基酸的修饰
      - 五、添加辅因子
      - 六、寡聚蛋白质的寡聚化
      - 七、蛋白质的折叠
    - 第二节蛋白质的定向转运与分拣
      - 一、信号学说
      - 二、蛋白质的共翻译定向与分拣
      - 三、蛋白质的翻译后定向
    - 第三节蛋白质在细胞内的降解
      - 一、细胞内不依赖于ATP的蛋白质降解
      - 二、细胞内依赖于ATP的蛋白质降解
      - Box42-2 生化小故事：“N端规则”的发现
      - Box42-3 生化应用：一种基于泛素-蛋白酶体的疾病治疗技术——PROTAC的问世
    - 科学故事——“信号学说”的提出和证明
  - 第四十三章基因表达调控
    - 第一节原核生物的基因表达调控
      - 一、在DNA水平上的调控
      - 二、在转录水平上的调控
      - Box43-1 “核开关”的发现
      - 三、在翻译水平上的调控
      - 四、环境信号诱发的基因表达调控
      - Box43-2 科学家终于在真核生物体内发现了新型的CRISPR-Cas样系统，也可用于基因组编辑
      - 五、在基因组水平上的全局调控
    - 第二节真核生物的基因表达调控
      - 一、在染色质水平上的基因表达调控
      - 二、在DNA水平上的基因表达调控
      - 三、在转录水平上的基因表达调控
      - 四、转录后加工水平上的基因表达调控
      - 五、翻译及翻译后加工水平上的调控
      - Box43-3 生化小故事：RNAi的发现
      - Box43-4 生化研究动态——我们吃的不仅是食物，也许还有“信息”
    - 科学故事——CRISPR-Cas9系统的“前身今世”
  - 第四十四章分子生物学技术
    - 第一节重组DNA技术简介
      - 一、基因克隆的载体
      - 二、将外源基因或序列导入载体的工具
      - 三、宿主细胞
      - 四、将重组DNA引入宿主细胞的途径
      - 五、重组体的选择和筛选
    - 第二节重组DNA技术的详细步骤
      - 一、外源DNA序列和目的基因的获得
      - 二、目的基因与载体的连接
      - 三、重组DNA导入特定的宿主细胞
      - 四、含有目的基因序列的克隆的筛选与鉴定
    - 第三节重组DNA技术的应用
      - 一、文库的建立
      - 二、DNA序列分析
      - 三、表达外源蛋白
      - 四、转基因动物、植物及转基因食品
      - 五、基因治疗
      - 六、基因功能的研究
      - 七、寻找未知基因
      - Box44-1 生化新突破——人造生命的诞生
    - 第四节聚合酶链式反应
    - 第五节蛋白质工程
      - 一、随机突变
      - 二、定点突变
      - 三、蛋白质的定向进化
    - 第六节研究蛋白质之间相互作用的主要方法
      - 一、免疫共沉淀
      - 二、亲和层析
      - 三、共价交联
      - 四、荧光共振能量转移技术
      - 五、表面等离子体共振技术
      - 六、酵母双杂交
      - 七、捕拉分析
    - 第七节研究核酸与蛋白质相互作用的主要方法
      - 一、电泳泳动变化分析
      - 二、亲和层析
      - 三、免疫沉淀
    - 第八节指数富集式配体系统进化技术
    - 第九节生物芯片技术
      - 一、基因芯片
      - 二、蛋白质芯片
    - 第十节基因组编辑技术及其扩展
      - 一、依赖特定内切核酸酶的基因组编辑
      - 二、不依赖内切核酸酶的基因组编辑
      - 三、表观基因组编辑
      - 四、RNA编辑
      - 五、CRISPR-Cas9全基因组筛选
      - Box44-2 揭开Ⅳ型CRISPR-Cas系统之谜：有望成为对抗超级细菌的新工具
    - 科学故事——PCR的发明
- 附录一历届与生物化学有关的诺贝尔生理学或医学奖得主及其获奖成就
- 附录二历届与生物化学有关的诺贝尔化学奖得主及其获奖成就

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